בשנות ה-80 נתמנה לר"מ בישיבת מהרי"ל על שמו של הרב יהושע לייב דיסקין בבניין בית היתומים דיסקין. בראשות הישיבה עמד הרב רפאל יונה טיקוצ'ינסקי. לאחר שהרב טיקוצ'ינסקי העתיק את ישיבתו לירוחם נתמנה על ידי סבו הרב אברהם יצחק רוטשטיין לראש ישיבת מהרי"ל[2].
הישיבה כללה קיבוץ בלבד, מתוך הכרה כי שיטתו של...