גר"ח תלמיד הגר"א כתב בשו"ת חוט המשולש חלק א סימן ט, "כבר הוזהרתי בזה מפי מורי קדוש ישראל רבינו הגדול הגאון החסיד מוהר"א נ"ע מווילנא, שלא לישא פנים בהוראה וכו'", וה-וכו' הלזה, כוונתו כמש"כ בספר עליות אליהו הערה סב, "...שלא לישא פנים בהוראה אף להכרעת רבותינו בעלי השו"ע".
והחזו"א יו"ד סי' קנ אות י כתב, "וכן אחר שו"ע אנו נוהגין להורות ע"פ גדולי האחרונים אף נגד השו"ע, כמו הש"ך פר"ח הגר"א, וכן אנו סומכים בדינים פרטיים על אחרונים ז"ל אף נגד השו"ע כגון הנו"ב ועוד".
ובחו"מ ליקוטים סי' א כתב החזו"א, "ואף שאנו נוהגים ע"פ השו"ע, מ"מ אנו רגילים לנטות מהשו"ע מחמת שנטו אחרונים...".